木薯ETR1基因克隆及表达分析

作者:陈志晟颜彦赵思涵田丽波商桑胡伟

关键词: 木薯; 乙烯受体（ETR）; MeETR1基因; 生理性变质（PPD）; 表达分析;

摘要：【目的】克隆木薯乙烯受体基因（MeETR1）并检测其在木薯采后生理性变质（PPD）过程中的表达情况,为研究ETR基因家族在木薯PPD过程中的功能作用提供参考依据。【方法】以木薯品种华南8号为材料,应用PCR扩增MeETR1基因编码区（CDS）序列,采用生物信息学分析方法对其编码蛋白的理化性质、亲/疏水性、保守结构域及二、三级结构等进行预测分析,通过亚细胞定位确定MeETR1蛋白在植物细胞中的表达分布,并利用实时荧光定量PCR检测MeETR1基因在木薯采后PPD过程的表达情况。【结果】克隆获得MeETR1基因CDS序列全长2220 bp,共编码739个氨基酸,蛋白分子量为82.88 kD,理论等电点（p I）为6.76;MeETR1基因编码蛋白属于疏水蛋白,含有ETR1家族4个典型模块,即GAF结构域、HisKA结构域、HATPasec结构域和REC结构域;其二级结构中α-螺旋占47.43%、延伸链占14.46%、无规则卷曲占38.11%。MeETR1氨基酸序列（XP021625986.1）与同属大戟科的蓖麻（Ricinus communis）ETR1氨基酸序列（XP002533252.1）相似性为92.42%,亲缘关系较近;MeETR1蛋白定位在细胞质中。与0 h（PPD前）相比,MeETR1基因的相对表达量在木薯采后PPD过程中（12、24、48和96 h）均呈显著下降趋势（P<0.05）,即MeETR1基因表达受木薯采后PPD过程的抑制。【结论】MeETR1基因编码蛋白含有GAF、HisKA、HATPasec和REC等4个典型的结构域,与其他植物ETR1在生物学功能上具有一致性;MeETR1基因表达在木薯采后PPD过程中受抑制,可能在此过程中发挥负调控作用。

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木薯ETR1基因克隆及表达分析

作者:陈志晟 颜彦 赵思涵 田丽波 商桑 胡伟

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作者:陈志晟颜彦赵思涵田丽波商桑胡伟