澳洲坚果MYB1基因克隆及生物信息学分析

作者:王文林韦媛荣郑树芳谭秋锦覃振师黄锡云汤秀华樊松乐王立丰陈海生

关键词: 澳洲坚果; MiMYB1基因; R2R3-MYB家族; SANT保守结构域; 抗逆性;

摘要：【目的】从澳洲坚果（Macadamia integrifolia）叶片中克隆MYB1转录因子基因（MiMYB1）并进行生物信息学分析,为揭示R2R3-MYB家族转录因子成员在澳洲坚果中的抗逆作用机制提供参考依据。【方法】利用PCR从澳洲坚果品种桂热一号叶片中克隆MiMYB1基因,采用ProtParam、TMHMM Server v.2.0和SMART:Main page等在线分析软件对MiMYB1蛋白进行生物信息学分析,运用DNAMAN 7.0进行蛋白氨基酸多序列比对分析,并从NCBI中选取126个拟南芥R2R3-MYB家族成员,以Geneious Pro v4.8.4中的邻接法（Neighbor-joining,NJ）构建系统发育进化树。【结果】从澳洲坚果品种桂热一号叶片中克隆获得的MiMYB1基因序列全长1205 bp,包含1062 bp的开放阅读框（ORF）,共编码353个氨基酸,GenBank登录号为MN254975。MiMYB1蛋白具有2个SANT保守结构域,属于R2R3-MYB家族,是无跨膜结构、无信号肽且定位于细胞核的不稳定亲水性蛋白。MiMYB1氨基酸序列（MN254975）与荷花NnMYB39氨基酸序列（XP010277911.1）的亲缘关系最近,相似性为71.81%;与哥伦比亚锦葵HuMYB102-like（XP021293847.1）、榴莲DzMYB102-like（XP022777375.1）、木薯MeMYB102-like（XP021596793.1）和高山栎QsMYB102-like（XP023877052.1）的MYB氨基酸序列相似性分别为67.47%、68.63%、64.44%和67.28%。MiMYB1蛋白与126个拟南芥R2R3-MYB家族成员的系统发育进化分析结果显示,MiMYB1与AtMYB41的亲缘关系最近,与AtMYB41、AtMYB74和AtMYB102同属于S11亚族,具有相似的生物学功能,即与植物抗逆性功能相关。【结论】MiMYB1是典型的植物R2R3-MYB转录因子,在澳洲坚果的抗逆反应中发挥作用。

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澳洲坚果MYB1基因克隆及生物信息学分析

作者:王文林 韦媛荣 郑树芳 谭秋锦 覃振师 黄锡云 汤秀华 樊松乐 王立丰 陈海生

关键词: 澳洲坚果; MiMYB1基因; R2R3-MYB家族; SANT保守结构域; 抗逆性;

作者:王文林韦媛荣郑树芳谭秋锦覃振师黄锡云汤秀华樊松乐王立丰陈海生