达氏鲟自噬基因MAP1LC3B克隆及其组织表达分析

作者:胡伟许巧情郭慧芝李由申韩盼盼袁汉文张书环陈敦学

关键词: 达氏鲟; 自噬; 微管相关蛋白1A 1B轻链3B（MAP1LC3B）; GABARAP泛素结构域; 抗病机制;

摘要：【目的】掌握达氏鲟微管相关蛋白1A/1B轻链3B基因（MAP1LC3B）的表达模式,为后续研究MAP1LC3B基因功能及揭示达氏鲟的抗病分子机制提供理论依据。【方法】采用RACE技术从达氏鲟组织中克隆MAP1LC3B基因,通过ProtParam、TMpred、Phyre2及Singal 4.1等在线软件进行生物信息学分析,同时借助实时荧光定量PCR检测MAP1LC3B基因在达氏鲟不同组织中的表达情况。【结果】达氏鲟MAP1LC3B基因cDNA序列全长2208 bp,包含378bp的开放阅读框（ORF）、202 bp的5’端非编码区（5’-UTR）和1628 bp的3’端非编码区（3’-UTR）,编码125个氨基酸。MAP1LC3B氨基酸序列含有GABARAP泛素结构域、Agt7结合位点、脂化位点和维管束蛋白结合位点。达氏鲟MAP1LC3B蛋白由18种氨基酸组成,其中谷氨酸（Glu）含量最高（占9.6%）、丙氨酸（Ala）含量最低（占1.6%）;蛋白分子量为14743.01 Da,理论等电点（pI）为8.92,不稳定系数为65.12,总平均亲水性为-0.484,是一种不稳定的疏水性蛋白,且不存在跨膜结构,也无信号肽序列。MAP1LC3B基因在达氏鲟鳃、脑、皮肤、头肾、前肾、脾脏、中肾、心脏和肠道等组织中均有表达,以在鳃和肠道组织中的相对表达量较高,显著高于在其他组织中的相对表达量（P<0.05）。【结论】达氏鲟MAP1LC3B基因具有较高的保守性,在鳃和肠道黏膜免疫组织中高表达,表明自噬参与达氏鲟黏膜免疫过程,调节机体免疫反应。

上一篇：广西不同地区克氏原螯虾群体遗传多样性微卫星分析
下一篇：金边鲤皮肤黑色素合成及转运相关基因表达分析

达氏鲟自噬基因MAP1LC3B克隆及其组织表达分析

作者:胡伟 许巧情 郭慧芝 李由申 韩盼盼 袁汉文 张书环 陈敦学

关键词: 达氏鲟; 自噬; 微管相关蛋白1A 1B轻链3B（MAP1LC3B）; GABARAP泛素结构域; 抗病机制;

作者:胡伟许巧情郭慧芝李由申韩盼盼袁汉文张书环陈敦学