- · 院科技处组织召开2名博士后出站考核报告会[01/11]
- · 玉米所科技人员参加2020年度广西薯类创新团队总结考评会[01/10]
- · 柳州市柳江区科学技术局人员到葡萄所开展科技工作交流[01/09]
- · 蔬菜所与柳州市柳江区科学技术局开展产学研平台建设座谈会[01/08]
- · 广西热作所农产品质量安全产业科技先锋队到博白县、北流市开展科技服务[01/08]
- · 广西甘蔗生产服务公司人员到甘蔗所座谈交流[01/08]
- · 生物所组织开展防冻抗灾工作[01/07]
- · 广西创新驱动发展专项《广西甘蔗原料蔗亩增1吨关键技术粉垄“145”模式研究与示范》项目启动会在崇左召开[01/07]
2000—2019年广西狂犬病病毒流行株的基因组遗传稳定性分析
作者:覃晴 梁星雪 曹晗 韦显凯 梁晶晶 李晓宁 罗廷荣
关键词: 狂犬病病毒(RABV) 基因组 遗传稳定性 GroupⅡ型毒株
摘要:【目的】揭示广西狂犬病病毒(RABV)的流行变异规律及进化特征,为广西狂犬病防控提供科学依据。【方法】对2018年从患狂犬病家犬脑组织分离获得的2株RABV野毒株(GXYZ2018和GXSL2018)进行全基因组扩增与测序,测序结果采用Seq Man进行拼接以获得全基因组序列,并与近20年来的RABV广西流行株进行系统地遗传变异分析。【结果】GXSL2018株和GXYZ2018株的全基因组序列长度均为11923 bp,不同RABV广西流行株间的核苷酸序列同源性在87.1%~99.4%,而2株毒株间的同源性为99.1%;与其他RABV广西流行株相比,GXSL2018株和GXYZ2018株的3’-UTR为69 bp,且在第20位缺失一个核苷酸。基于N基因和G基因核苷酸序列同源性构建的遗传进化树均显示GXSL2018株和GXYZ2018株同属于Group Ⅱ型毒株,且2株毒株N蛋白上的B细胞表面抗原表位(第358~367位氨基酸残基)、Th细胞表位(第404~418位氨基酸残基)和RNA结合域(第298~352位氨基酸残基),以及G蛋白上与病毒毒力密切关联的第333、336、339和357位氨基酸残基及中和抗体相关表位和受体结合位点均高度保守。【结论】GXYZ2018株和GXSL2018株同属于Group Ⅱ型毒株,与近20年来的RABV广西流行株高度相似,病毒蛋白主要功能区的氨基酸序列高度保守,尚未发生变异,全基因组遗传特性稳定。